※2022年12月18日移転グランドオープン
作家の落合恵子が「子どもも大人も、一人ひとりが自分でいられる場を作りたい」という思いから、レストランを併設した子どもの本の専門店として1976年に立ち上げた店。2022年12月に表参道から吉祥寺に移転した。
地下1階には小さなギャラリーがあり、絵本作家・長谷川義史が描いた旧クレヨンハウスの絵などが鑑賞できる。1階には、有機JAS認証を取得した国産の有機野菜やオーガニックフーズを扱う野菜市場、「ケーキおばさん」のケーキ、オーガニック食材を使った料理が楽しめるレストラン「広場」がある。また、奥のコーナーでは、オーガニックコスメや落合恵子デザインのオーガニックコットンブランド、「ミズ・クレヨンハウス」のインナーやアウター、布ナプキンをはじめとする生活雑貨が購入できる。
2階には子どもの本を中心とした書籍、木のおもちゃが並ぶ。表参道店ではオーガニックコスメと同じエリアにあった、ジェンダー問題などをテーマとする大人向けの書籍は同階に移動した。